На внутрішньому дворі Старого замку проводяться розкопки згідно договору між музеєм та державним підприємством "Науково-дослідний центр "Охоронна археологічна служба України" Інституту археології НАН України.
На території Кам’янець-Подільського замку під час розкопок на місці розташування церкви Покрови Богородиці ХІV-ХVІІ ст. та костелу св. Станіслава кін. ХVІ- поч. ХІХ ст. команда археологів під керівництвом Лариси Іванівни Виногродської знайшла п’ять могил періоду Давньої Русі.